AI解码生命密码,从AlphaFold到诺奖,清华聂再清畅谈大模型与生物语言的双向奔赴
2024年,诺贝尔化学奖授予了“蛋白质结构预测”领域的突破性进展,而背后最耀眼的“功臣”之一,正是人工智能(AI)——尤其是深度学习大模型在生物语言解码中的革命性应用,这一里程碑事件不仅印证了AI驱动生命科学进入“新纪元”,更将一个核心命题推向台前:如何利用大模型“读懂”生命的“语言”,并最终攻克疾病、优化生物制造等全球性挑战?带着这一疑问,我们专访了清华大学人工智能研究院副院长、清华大学生物医学工程系教授聂再清,深入探讨AI与大模型如何重塑蛋白质研究的未来,以及中国在这一前沿领域的机遇与担当。
从“AlphaFold时刻”到诺奖:AI为何能“破解”蛋白质结构?
皇冠信用盘开户官网 “蛋白质是生命的‘执行者’,其结构直接决定功能,但传统实验方法解析蛋白质结构耗时耗力,一个蛋白的结构解析往往需要数年甚至数十年。”聂再清教授开篇即点出蛋白质研究的核心痛点。
皇冠官网注册 2020年,DeepMind开发的AlphaFold2凭借惊人的预测精度,首次实现“秒级”预测蛋白质三维结构,被誉为“生物学领域的AlphaGo时刻”,而2024年诺奖的授予,更是将这一突破推向了科学之巅。“AlphaFold的成功并非偶然,它本质上是AI对生物语言的‘深度理解’。”聂再清解释,蛋白质的氨基酸序列是其“一级语言”,而三维结构则是“语法规则”——大模型通过学习海量已知蛋白质序列与结构的对应关系,就像人类通过学习语料掌握语言规律一样,最终实现了从“序列”到“结构”的精准翻译。
“但AlphaFold只是开始。”聂再清强调,蛋白质研究的终极目标不仅是“预测结构”,更是“理解功能、设计功能”,如何通过设计特定蛋白质靶向癌细胞?如何优化酶的催化效率以实现绿色制造?这些问题需要AI从“结构预测”走向“功能解码与设计”——这正是当前大模型研究的下一个“无人区”。 皇冠登2
生物语言的“双向奔赴”:大模型如何从“读懂”到“改写”?
聂再清团队长期致力于“生物医学大模型”的研发,其主导的“BioTransformer”等项目,正是围绕“生物语言”的“双向解码”展开。
“生物语言不仅包括蛋白质序列,还包括基因调控网络、细胞信号通路、药物分子相互作用等复杂系统。”聂再清指出,传统AI模型往往局限于单一任务(如仅预测结构),而大模型的优势在于“多任务融合”与“跨模态理解”。“就像ChatGPT能同时处理文本、翻译、问答一样,生物大模型可以整合基因组、转录组、蛋白质组等多维度数据,构建生命的‘全景图谱’,从而回答‘这个基因突变为何会导致疾病’‘这个药物靶点在哪里’等复杂问题。”
以蛋白质设计为例,传统“理性设计”依赖试错,效率极低;而基于大模型的“生成式AI”则能像“AI画家”一样,根据功能需求“绘制”出全新的蛋白质序列。“我们正在训练的大模型,可以输入‘需要一种能结合新冠病毒刺突蛋白且不易逃逸的抗体序列’,它就能生成数十万种候选结构,并通过虚拟筛选锁定最优解。”聂再清举例道,这将极大加速抗体药物、疫苗的研发进程。
“更重要的是,大模型正在实现从‘被动预测’到‘主动设计’的跨越。”他补充道,“我们或许可以通过AI直接设计出具有光合作用的人工蛋白质,甚至构建全新的生命体——这不仅是技术的突破,更是人类对生命认知的颠覆。”
中国力量:在AI蛋白质赛道如何“弯道超车”?
当全球AI蛋白质研究进入“百舸争流”的阶段,中国如何把握机遇?聂再清认为,核心在于“数据、算法、场景”的三位一体。
欧博注册登录 “数据是基础,中国拥有丰富的临床样本和生物资源,这是我们的优势。”他强调,需要建立高质量、标准化的生物数据库,并推动数据共享;“算法是引擎,要结合清华等高校在数学、计算机科学、生物学交叉领域的积累,开发更具‘生物可解释性’的大模型——不仅要知道‘是什么’,还要明白‘为什么’;场景是目标,要聚焦国家重大需求,如肿瘤治疗、传染病防控、农业育种等,让AI真正落地为生产力。”
聂再清团队正在推进的“AI驱动的个性化新药研发”项目,正是这一思路的实践。“以肿瘤免疫治疗为例,每个患者的突变谱不同,我们希望通过大模型分析其肿瘤抗原特征,设计个性化的肿瘤疫苗,实现‘一人一策’的精准治疗。”
他也呼吁加强跨学科人才培养。“AI蛋白质研究需要既懂计算机算法,又熟悉分子生物学的‘复合型人才’,清华正在推动‘AI+X’交叉学科建设,希望培养更多能‘用AI思维思考生物问题,用生物逻辑验证AI结果’的新一代科研力量。” www.mos033.com
未来已来:AI将如何重塑生命科学的“底层逻辑”?
展望未来,聂再清描绘了一幅激动人心的图景:“AI将成为生物学家的‘智能助手’,甚至‘合作伙伴’,科研人员只需提出问题,AI就能自动完成数据收集、模型预测、实验设计、结果分析的全流程,人类则更专注于提出科学假设、解读底层规律。”
欧博注册会员 但他也提醒,AI并非“万能钥匙”。“蛋白质是复杂的动态系统,其功能受环境、细胞状态等多种因素影响,目前大模型对动态过程的模拟仍有局限,AI设计的蛋白质需要实验验证,‘湿实验’与‘干实验’的结合永远不可替代。”
从AlphaFold到诺奖,从“预测”到“设计”,AI与大模型正在重新定义人类与生命对话的方式,正如聂再清所言:“生命的语言或许是宇宙中最复杂的密码,但AI给了我们一把‘金钥匙’,在这场探索中,中国不仅要‘跟跑’,更要‘并跑’、‘领跑’,用智慧与创新,解码更多生命的奥秘,为人类健康与可持续发展贡献中国方案。” 亚星官网333
这场由AI驱动的“生物语言革命”,才刚刚拉开序幕。